组织病理可见表皮棘细胞松解现象。有的棘层细胞过早角他，呈圆形红染的均匀染色，称为圆体。有的棘层细胞缩小，胞核浓染缩小呈深蓝紫色，称为谷粒，生殖器疱疹组织病理症状与家族性良性天疱疮有所不同。